A Capela São Francisco de Assis está localizada no segundo andar do Prédio 15, no Conjunto III. Inaugurada no final de 2015, a Capela congrega harmonicamente um espaço de encontro pessoal e comunitário com Deus. Com a capacidade de receber até 500 pessoas pessoas, na Capela acontecem celebrações semanais abertas à Comunidade Externa todas as terças-feiras, às 17h30, além das Missas de Formatura e outras missas solenes da instituição.